Wat ga je doen

Jij bent onderdeel van een team van 5 bioinformatici. Binnen dit team ben jij verantwoordelijk voor het automatiseren van lab processen. Deze processen ontwikkel en implementeer je in nauwe samenwerking met laboratorium analisten en labspecialisten. Je bent continue met innovatie bezig waarbij jij de vertaalslag maakt van de vraag uit de praktijk naar de mogelijkheden in het ontwikkelen van geautomatiseerde processen. Hiermee draag je direct bij aan het verbeteren van de patiëntenzorg. Aangezien ons doel is op korte termijn toe te werken naar een vernieuwd LIMS systeem, is er ruime mogelijkheid mee te denken over hoe het toekomstige LIMS systeem vormgegeven dient te worden.

Hierbij zullen je belangrijkste werkzaamheden bestaan uit:

  • Verantwoording dragen voor bestaande LIMSsystemen;
  • Opstellen van requirements voor automatisering van labprocessen in nauw overleg met de gebruikers;
  • Implementeren van nieuwe labautomatisering;
  • Testen, valideren en documenteren van opgeleverde software om aan kwaliteitseisen (ISO 15189) te voldoen.

Wat we van je verwachten

Voor deze functie zijn we op zoek naar een software engineer die voldoening haalt uit het behalen van resultaten op de korte termijn. Hierbij speel je met het automatiseren van labprocessen proactief in op de behoeften en mogelijkheden die je signaleert in samenspraak met het team. Gezien de nauwe samenwerking binnen het team en het multidisciplinaire werkveld, is het belangrijk dat je goede communicatieve vaardigheden bezit en graag je eigen kennis wilt verbreden. Onder een goede communicatie verstaan wij ook dat je in staat bent duidelijke en haalbare verwachtingen te scheppen. Bovenal vind je het belangrijk dat je met jouw werkzaamheden een belangrijke bijdrage levert aan het verbeteren van de patiëntenzorg.

Daarnaast voldoe jij aan de volgende vereiste:

  • Je hebt een BSc of MSc in de (bio)informatica of gerelateerde richting;
  • Je bent bekwaam in scripting taal (Python / Perl);
  • Je bent bekwaam met moderne programmeertalen (Java / C# / C++);
  • Je bent bekend met het MVC model;
  • Je bent bekend met code management systemen (git / mercurial);
  • Je hebt kennis van kwaliteitssystemen.

Waar ga je werken

Het bioinformatica team is ingebed in de sectie Genoomanalyse van de afdeling Klinische Genetica. Onze hoofdtaak bestaat uit het analyseren en verwerken van grote hoeveelheden genomics data ten behoeve van directe patiëntendiagnostiek. Om deze patiëntendiagnostiek snel en efficiënt uit te kunnen voeren, beschikt de afdeling over geautomatiseerde liquid handling systemen van ondermeer Qiagen, Beckman Coulter en Hamilton. Voor het sequencen beschikken we momenteel over apparatuur van Illumina (HiSeq 4000, NextSeq, MiSeq) en Thermo Fischer (Ion S5XL, IonTorrent). Het bioinformatica team beschikt over een eigen 256 core HPC cluster om de grote hoeveelheid data te verwerken. Met deze middelen zijn we in staat om snel en efficiënt meer dan 800 bloed samples per week te verwerken voor de Niet Invasieve Prenatale Test (NIPT). Daarnaast verwerken we wekelijks zowel kleine targeted (amplicon) panels als grotere Whole Exome en Whole Genome Sequencing onderzoeken en werken we veelvuldig samen met onderzoeksgroepen aan Liquid Biopsies, CRISPR/CAS technieken en (single cell) RNAseq toepassingen. Ons team is een groeiend jong gezelschap en gedreven om het verschil te kunnen maken in de genoomdiagnostiek, welke in toenemende mate afhankelijkheid is van complexe data analyse. De inbedding in het laboratorium en de setting van een academisch medisch centrum biedt daarvoor, met de kennis en contacten, een ideale omgeving.

Wat we je bieden

Salarisschaal 8: 2616 tot 3508 euro bruto bij een fulltime dienstverband (afhankelijk van opleiding en ervaring).

  • Naast een goed basissalaris bieden we onder andere 8,3% eindejaarsuitkering en 8% vakantietoeslag. Wil jij weten wat je gaat verdienen? Bereken dan hier jouw netto salaris (onder voorbehoud).
  • Je pensioen wordt opgebouwd bij het ABP. VUmc draagt 2/3e deel van deze premie bij.
  • Wij vergoeden 75% van je OV reiskosten.
  • In eerste instantie bieden wij jou een jaarcontract, met uitzicht op verlenging

Voor meer informatie over onze arbeidsvoorwaarden kijk op onze website.

Bijzonderheden

Een screening kan onderdeel zijn van de selectieprocedure. Het aanvragen van een VOG (Verklaring Omtrent Gedrag) is voor iedere nieuwe medewerker verplicht. Klik hier voor meer informatie over de screeningsprocedure en of deze op jou van toepassing is.

Laten we kennismaken

Bel ons gerust!
Voor inhoudelijke informatie kun je contact opnemen met dr. Daoud Sie, hoofd bioinformatica, via 020 – 444 2428.
Voor meer informatie over de sollicitatieprocedure kun je contact opnemen met Brend de Jong, corporate recruiter, via 020 – 444 5635.

Je kunt uiterlijk tot en met 24 maart 2019 solliciteren via de button.

Acquisitie naar aanleiding van deze vacature wordt niet op prijs gesteld.